航海学院于1992年9月由原航海系（成立于1953年）、电子工程系（成立于1962年）和航政系（成立于1989年）合并而成。
航海学院现有航海技术、海事管理和地理信息系统三个本科专业。航海技术专业在国内外享有较高的知名度，是1953年并校时保留并进一步发展起来的重点专业，1992年被列为交通部“八五”首批重点建设学科专业，支持交通信息工程及控制、航海科学与技术二个二级学科硕士和博士点。学院已形成博士、硕士、本科等多层次、多方式的办学体系，以培养硕士研究生和本科生为主，并招收国外留学生。
航海学院下设航海、船艺、货运、航海仪器、船舶安全管理、通信、航海气象与地理信息、海事管理8个教研室，IMO国际公约研究中心、航海英语研究中心和航海实验实践教学中心3个中心以及航海技术研究所。航海实验实践教学中心下设航海气象天象馆与航海图书资料、船艺、航海仪器、计算机积载、航海模拟器、LNG、GMDSS通信和海事管理等9个实验室，既可供培养适应现代化船舶驾驶与管理的高级航海技术人才教学使用，也可供广大教师、高年级学生、研究生进行科学研究。
航海学院师资力量雄厚，已经获得国家级教学团队1个，省级教学团队1个，具有教授、副教授高级专业技术职称的教师占教师总数一半以上，形成了以国内外航海界知名度高、影响大、学术造诣深的教授为带头人，以具有博士、硕士学位的中青年骨干教师为主力的多支学术梯队。航海学院现有教师161人，其中教授32人、副教授58人，实验技术人员18人。29人持有符合国际船员培训发证值班标准的船长证书或高级船长证书，13人持有大副证书。教师经常参与国内外学术交流、访问和进修，已成为国内多个学术组织的成员及国际海事组织的专家顾问。
学院有较强的科研能力，主要研究方向是交通系统虚拟现实与仿真技术、交通信息工程及控制系统、交通运输先进控制理论及技术、船舶货运技术、船舶驾驶自动化、船舶操纵及航行环境综合评价等。近年来承担国家自然科学基金、交通部及部属单位多项横向科研项目，多项研究成果处于国内领先或达到国际先进水平，并获得国家级、省部级科技进步奖，为我国航海科技水平的提高做出了重要贡献。
航海学院除承担本科生、研究生教学与科学研究工作外，与世界海事大学大连分校等合作办学，并根据国际海事组织（IMO）的标准，为国内航海院校和航海教育培训机构培养师资，为航运企业培训船长和驾驶员，成为国家高级航运人才的重要培养基地。
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