食品工程学院始建于1958年。目前，学院下设五个教研室：食品工程教研室、食品安全教研室、生物工程教研室、环境工程教研室和化学教研室；一个研究所：食品工程研究所；两个中心：省高校食品基础化学实验教学示范中心和分析检测中心；一个省级重点实验室：食品科学与工程实验室。拥有“食品科学与工程”、“生物工程”、“食品质量与安全”、“环境工程”4个本科专业， 一个“食品科学”二级学科博士学位授权点，一个“食品科学与工程”一级学科硕士学位授权点（涵盖食品科学、粮食油脂及植物蛋白工程、农产品贮藏与加工和水产品贮藏与加工四个硕士学位授权点）和一个“发酵工程”二级学科硕士学位授权点。1996年，食品科学学科被国内贸易部确认为部级重点学科，2000年又被黑龙江省评定为省级重点学科。
学院现有教职工68人，专任教师47人，其中教授15人，副教授16人，高级工程师6人，具有博士学位的教师12人，具有硕士学位的教师23人。硕士生导师18人，博士生导师2人，享受国务院政府特殊津贴的专家2人，享受省政府特殊津贴的专家1人，省级学科带头人2人，龙江学者1人。目前全日制在校本科生1214人，截止到2007年7月本院已向社会输送本专科毕业生3000余人，研究生176人。
到“十五”末取得科研成果145项，获得各级政府奖励共38项，获得发明专利10项，出版学术专著与教材55部，发表学术论文1432篇。学院实验室配有大批先进的仪器设备，为学科的发展奠定了良好的基础。
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