重庆医科大学体育工作部成立于1997年，由原基础医学院体育教研室发展而来。
体育工作部作为以全校学生体育课程教学、体育科学研究、学生体质健康、群体活动、运动竞赛为主要任务的教学机构，具有较强的体育专业师资力量和竞赛裁判队伍。目前有教职工30人，其中运动医学专业硕士生导师2人；硕士学位9人，副教授4人，讲师19人，助教2人；国际级裁判1人、国家一级裁判16人；国家一级健身教练员1人，救生员21人。
我校体育场馆设施完善，功能齐全，数量充足。校本部拥有标准400米塑胶跑道田径场1个，人造草皮足球场1个；多功能室外塑胶篮球场8个，排球场4个，羽毛球场6个，乒乓球台26座,塑胶网球场1个；带循环水系统标准化游泳池1个，简易体育练习场1个。
重庆医科大学体育工作部成立于1997年，由原基础医学院体育教研室发展而来。2007年，我校大学城缙云校区投入使用，新建成一批崭新、现代的体育运动场馆：多功能体育馆1个（具有篮、排球、羽毛球、乒乓球、健美操、健身舞蹈训练功能），标准400米塑胶跑道田径场1个，标准人造草皮足球场1个，室外塑胶篮球场19个，排球场6个，羽毛球场9个，乒乓球台24张，网球场2个，简易训练场1个。
2006年以来，体育工作部以国家教育部颁发的《全国普通高等学校体育课程教学指导纲要》为指导，以人为本，深入贯彻“健康第一，终身体育”的指导思想，与时俱进，立足自身基础学科位置，加强学科建设，以教学为第一要务，以培养身心健康的医务工作者为目标，积极在我校优化体育教学模式，推行“三自主”课程教学改革方案，改善教学环境，提高教学质量，建立健全高质量、完善的教学体系。拥有市教委教改课题。积极参加全国、省市各级科研论文报告会，积极发表论文和参编教材。
2011年 9月，体工部顺应高等教育发展趋势，从课程设置、师资力量配备、教学内容调整、优化组织教法、狠抓体育科学研究等方面入手，积极实施优化体育课程设置，改革体育课考试体系、全面提高体育课程教学质量的教改工程，使我校体育教学紧紧跟随学校发展之路走在高校体育教育的前沿。现在体工部拥有一支能够承担全英语留学生体育教学的高素质师资队伍，体育科学研究分别获得重庆市科委体育科学研究课题、重庆市教委教改课题一项，至此，我校体育科研工作打开新的局面。
为响应与贯彻国家全民健身运动的伟大战略决策，体育工作部狠抓学生身体素质，积极采取有效措施，实施《国家学生体质健康标准》，有效地促进了全校大学生的锻炼热情和体质的提高。群体活动方面每年组织开展 “三好杯”篮球、排球、足球、健美操、羽毛球、乒乓球、铁人三项赛、健身环校跑以及全校田径运动会等丰富多彩、愉悦身心、深受广大师生员工喜爱的群众性体育竞赛活动，这些活动参与人数多，影响深远，有效地促进了我校“健康校园”文化建设。
竞技体育领域，我校成立了田径、篮球、排球、足球、健美操、游泳、羽毛球、乒乓球等多项校运动代表队，积极参加省市大学生运动会，近年来为学校争得多项荣誉。
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